SCHLESWIG-HOLSTEIN UND HAMBURG
Altona-Kaltenkirchen-Neumünster-Eisenbahn AG 
Hamburg-Eidelstedt - Ulzburg - Kaltenkirchen - Neumünster
Elmshorn - Barmstedt - Ulzburg
Ulzburg - Norderstedt
Tiefstack - Glinde (nur Güterverkehr)
Bergedorf - Geesthacht (nur Güterverkehr)
Nordbahn Eisenbahngesellschaft mbH
Neumünster - Bad Segeberg - Bad Oldesloe
Norddeutsche Eisenbahn-Gesellschaft mbH Niebüll
Niebüll - Dagebüll
Norddeutsche Eisenbahn-Gesellschaft Uetersen
Tornesch - Uetersen (nur Güterverkehr)
Nord-Ostsee-Bahn GmbH 
Hamburg-Altona - Husum - Niebüll - Westerland
Niebüll - Tønder
Husum - Bad St. Peter-Ording
Husum - Rendsburg - Kiel
Kiel - Neumünster
S-Bahn Hamburg GmbH 
S1/11: Poppenbüttel - Hbf - Wedel
S2/21: Pinneberg - Hbf - Bergedorf - Aumühle
S3/31: Pinneberg - Hbf - Harburg - Neugraben
Schleswig-Holstein-Bahn GmbH
Neumünster - Heide - Büsum
VKP Verkehrsbetriebe Kreis Plön
Kiel - Schönberg (nur Güterverkehr)
NIEDERSACHSEN UND BREMEN
ABE Ankum-Bersenbrücker Eisenbahn GmbH
Ankum - Bersenbrück (nur Güterverkehr)
Arriva
Leer - Nieuweschans - Groningen
BE Bentheimer Eisenbahn AG
Achterberg - Bad Bentheim - Nordhorn - Coevorden (nur Güterverkehr)
Borkumer Kleinbahn und Dampfschifffahrt GmbH
Borkum Reede - Borkum Bf
BThE Eisenbahn Bremen-Thedinghausen
Bremen - Kirchweyhe Nord - Thedinghausen (nur Güterverkehr)
Delmenhorst-Harpstedter Eisenbahn GmbH
Delmenhorst - Harpstedt (nur Güterverkehr)
Delmenhorst - Hasbergen (nur Güterverkehr)
Deutsche Regionaleisenbahn GmbH
Dannenberg - Lüchow (zur Zeit außer Betrieb)
Eisenbahnen und Verkehrsbetriebe Elbe-Weser GmbH 
Buxtehude - Bremervörde - Bremerhaven
Bremervörde - Osterholz-Scharmbeck (nur Güterverkehr)
Bremervörde - Zeven - Rotenburg(Wümme) - Brockel (nur Güterverkehr)
Tostedt - Zeven - Wilstedt (nur Güterverkehr)
Harsefeld - Hollenstedt (nur Güterverkehr)
EEB Emsländische Eisenbahn GmbH
Meppen - Haselünne - Essen(Oldenburg) (nur Güterverkehr)
Lathen - Werlte (nur Güterverkehr)
FVE Farge-Vegesacker Eisenbahn-Gesellschaft mbH
Bremen-Vegesack - Farge (nur Güterverkehr)
GET Georgsmarienhütte Eisenbahn und Transport GmbH 
Hasbergen - Georgsmarienhütte (nur Güterverkehr)
Ilm Ilmebahn GmbH
Einbeck-Salzderhelden - Einbeck Mitte - Dassel (nur Güterverkehr)
Metronom Eisenbahngesellschaft mbH 
Hamburg - Uelzen - Hannover - Göttingen
Hamburg - Bremen
Hamburg - Cuxhaven
Nordwestbahn GmbH 
Wilhelmshaven - Esens
Wilhelmshaven - Oldenburg - Osnabrück
Wilhelmshaven - Oldenburg - Bremen
Bremen - Vechta - Osnabrück
Bielefeld - Dissen-Bad Rothenfelde - Osnabrück
OHE Osthannoversche Eisenbahnen AG 
Winsen - Niedermarschacht (nur Güterverkehr)
Winsen - Hützel (nur Güterverkehr)
Lüneburg - Hützel - Soltau (nur Güterverkehr)
Soltau - Beckedorf - Celle (nur Güterverkehr)
Beckedorf - Munster (nur Güterverkehr)
Celle - Wittingen (nur Güterverkehr)
Wittingen - Rühen (nur Güterverkehr)
Wunstorf - Bokeloh (nur Güterverkehr)
RStV Rinteln-Stadthagener Verkehrs-GmbH (Betriebsführung OHE)
Rinteln - Stadthagen (nur Güterverkehr)
Schifffahrt der Inselgemeinde Langeoog - Inselbahn
Langeoog Hafen - Langeoog Bf
VWE Verden-Walsroder Eisenbahn GmbH
Verden - Stemmen (nur Güterverkehr)
Böhme - Walsrode (nur Güterverkehr)
VGH Verkehrsbetriebe Grafschaft Hoya (Betriebsführung OHE)
Eystrup - Bruchhausen-Vilsen - Heiligenfelde (nur Güterverkehr)
VPS Verkehrsbetriebe Peine-Salzgitter GmbH
Salzgitter Walzwerk - Salzgitter Erzvorbereitung - Salzgitter Finkenkuhle (nur Güterverkehr)
Salzgitter Erzvorbereitung - Lengede-Broistedt - Ilsede - Peine (nur Güterverkehr)
VLO Verkehrsgesellschaft Landkreis Osnabrück GmbH (früher Wittlager Kreisbahn)
Holzhausen-Heddinghausen - Bohmte (nur Güterverkehr)
VEV Vorwohle-Emmerthaler Verkehrsbetriebe GmbH 
Vorwohle - Bodenwerder - Emmerthal (nur Güterverkehr)
MECKLENBURG-VORPOMMERN
Mecklenburgische Bäderbahn Molli GmbH & Co. KG 
Bad Doberan - Ostseebad Kühlungsborn
Ostdeutsche Eisenbahn GmbH 
Hagenow - Ludwigslust - Karow - Neustrelitz
Neustrelitz Süd - Mirow
Ostseeland Verkehr GmbH 
Schwerin - Rehna
Schwerin - Parchim
Rostock - Laage - Güstrow
Bützow - Güstrow - Pasewalk - Ueckermünde
Pasewalk - Stettin
Stralsund - Neubrandenburg - Neustrelitz
Bergen - Putbus - Lauterbach Mole
RME Röbel-Müritz-Eisenbahn GmbH
Ganzlin - Röbel (nur Güterverkehr)
Rügensche Kleinbahn GmbH & Co. KG 
Lauterbach - Putbus - Binz - Göhren
Usedomer Bäderbahn 
Stralsund - Velgast - Barth
Stralsund - Greifswald - Züssow - Zinnowitz - Ahlbeck Grenze
Zinnowitz - Peenemünde
BRANDENBURG UND BERLIN
Buckower Kleinbahn
Buckow - Müncheberg
Deutsche Regionaleisenbahn GmbH
Falkenberg - Herzberg - Schlieben
Riesa - Falkenberg (zur Zeit kein Verkehr)
Schlieben - Uckro - Lübben - Beeskow (zur Zeit kein Verkehr)
Märkische Regiobahn
Berlin-Wannsee - Beelitz - Jüterbog
Brandenburg - Rathenow
Neukölln-Mittenwalder Eisenbahn AG
Hermannstraße - Berlin-Rudow (nur Güterverkehr)
Niederbarnimer Eisenbahn 
Berlin-Karow - Basdorf - Groß Schönebeck
Basdorf - Wensickendorf - Schmachtenhagen und Zehlendorf
Berlin-Rosenthal - Schönwalde (nur Güterverkehr)
Berlin - Küstrin
Ostdeutsche Eisenbahn GmbH 
Berlin-Lichtenberg - Ahrensfelde - Werneuchen - Tiefensee
Berlin-Lichtenberg - Eberswalde - Bad Freienwalde - Frankfurt (Oder)
Eberswalde - Joachimsthal - Templin
Berlin-Schöneweide - Königs Wusterhausen - Beeskow - Frankfurt (Oder)
Fürstenwalde - Bad Saarow-Pieskow
Osthavelländische Eisenbahn
Berlin-Spandau - Bürgerablage (nur Güterverkehr)
Prignitzer Eisenbahn GmbH 
Putlitz - Pritzwalk (nur Güterverkehr)
Pritzwalk - Meyenburg
Pritzwalk - Neustadt (Dosse) - Neuruppin
S-Bahn Berlin GmbH 
S1 : Wannsee - Nord-Süd-Bahn - Oranienburg
S2 : Blankenfelde - Nord-Süd-Bahn - Bernau
S25: Teltow Stadt - Nord-Süd-Bahn - Hennigsdorf
S3 : Ostbahnhof - Erkner
S41: Gesundbrunnen - Ostkreuz - Südkreuz - Westkreuz - Gesundbrunnen
S42: Gesundbrunnen - Westkreuz - Südkreuz - Ostkreuz - Gesundbrunnen
S45: Hermannstraße - Schöneweide - Flughafen Schönefeld
S46: Westend - Westkreuz - Südkreuz - Schöneweide - Königs Wusterhausen
S47: Südkreuz - Schöneweide - Spindlersfeld
S5 : Westkreuz - Stadtbahn - Strausberg Nord
S7 : Potsdam - Wannsee - Stadtbahn - Ahrensfelde
S75: Spandau - Stadtbahn - Wartenberg
S8 : Birkenwerder - Blankenburg - Ostkreuz - Schöneweide - Zeuthen
S85: Waidmannslust - Ostkreuz - Schöneweide
S9 : Spandau - Stadtbahn - Schöneweide - Flughafen Schönefeld
NORDRHEIN-WESTFALEN
Ahaus-Alstätter Eisenbahn GmbH (früher Ahaus-Enscheder Eisenbahn)
Ahaus - Alstätte (nur Güterverkehr)
Abellio Rail NRW GmbH 
Bochum - Wanne-Eickel
Essen - Bochum - Hagen - Letmathe - Finnentrop - Siegen
Letmathe - Iserlohn
Bahnen der Stadt Monheim GmbH
Langenfeld(Rheinl) - Monheim Nord (nur Güterverkehr)
Langenfeld(Rheinl) - Monheim Blee (nur Güterverkehr)
Veolia Verkehr (früher Connex-Gruppe)
Dampfkleinbahn Mühlenstroth 
Bergbahnen im Siebengebirge AG (Drachenfelsbahn) 
Königswinter - Drachenfels
EBM Eisenbahnverkehrsgesellschaft im Bergisch-Märkischen Raum GmbH
Hagen - Ennepetal-Altenvoerde (nur Güterverkehr)
EKML Eisenbahn Köln-Mülheim-Leverkusen
Köln-Mülheim - Leverkusen (nur Güterverkehr)
Die Euregiobahn 
Heerlen - Aachen - Stolberg-Altstadt
Alsdorf Annapark - Aachen - Eschweiler-Weisweiler
Eurobahn Verkehrsgesellschaft mbH & Co. KG 
Bielefeld - Lage - Lemgo
Bielefeld - Herford - Bünde - Rahden
Bünde - Löhne - Hameln - Hildesheim - Bodenburg
Mindener Kreisbahnen GmbH
Minden - Hille (nur Güterverkehr)
Minden - Todtenhausen (nur Güterverkehr)
Minden - Kleinenbremen (nur Güterverkehr)
Niederrheinische Verkehrsbetriebe AG
Moers - Rheinberg (nur Güterverkehr)
Moers - Hoerstgen-Sevelen (nur Güterverkehr)
Nordwestbahn GmbH 
Bielefeld - Dissen-Bad Rothenfelde - Osnabrück
Bielefeld - Paderborn - Holzminden
Münster - Bielefeld - Detmold - Altenbeken
Borken - Dorsten - Bottrop - Essen
Coesfeld - Dorsten
Dorsten - Herne - Dortmund
Prignitzer Eisenbahn GmbH 
Dortmund - Coesfeld - Enschede
Dorsten - Oberhausen - Duisburg-Ruhrort
Regiobahn GmbH 
Kaarst - Neuß - Düsseldorf - Mettmann
Mettmann - Dornap-Hahnenfurth (nur Güterverkehr)
Regionalverkehr Münsterland GmbH (früher Tecklenburger Nordbahn)
Osnabrück-Eversburg - Altenrheine (nur Güterverkehr)
Regionalverkehr Ruhr-Lippe GmbH 
Hamm - Uentrop - Vellinghausen (nur Güterverkehr)
Soest - Soest Süd (nur Güterverkehr)
Neheim-Hüsten - Arnsberg (nur Güterverkehr)
Neheim-Hüsten - Sundern (nur Güterverkehr)
Rhein-Sieg-Eisenbahn GmbH
Bonn-Beuel - Hangelar (nur Güterverkehr)
Siegburg - Lohmar (nur Güterverkehr)
Rurtalbahn GmbH 
Düren - Jülich - Linnich
Düren - Heimbach
Düren - Euskirchen
Kall - Gemünd
Jülich - Puffendorf (nur Güterverkehr)
Siegener Kreisbahn GmbH
Siegen Ost - Kaan-Marienborn (nur Güterverkehr)
Siegen-Weidenau - Deuz - Helgersdorf (nur Güterverkehr)
Herdorf - Neunkirchen - Pfannenberg (nur Güterverkehr)
Teutoburger-Wald-Eisenbahn AG 
Ibbenbüren - Gütersloh - Hövelhof (nur Güterverkehr)
Brochterbeck - Hafen Saerbeck (nur Güterverkehr)
Verkehrsbetriebe Extertal - Extertalbahn GmbH
Rinteln Süd - Barntrup (nur Güterverkehr)
Verkehrsverbund Rhein-Ruhr
WerBH Werne-Bockum-Höveler Eisenbahn (Deutsche Steinkohle AG)
Werne Ost - Bockum-Hövel (nur Güterverkehr)
WestfalenBahn GmbH
Herford - Lage - Detmold - Altenbeken - Paderborn
Bielefeld - Herford - Bünde - Osnabrück - Rheine - Bad Bentheim
Osnabrück - Münster
Rheine - Münster
WAB Westfälische Almetalbahn GmbH
Paderborn - Büren (nur Güterverkehr)
Westfälische Landeseisenbahn GmbH
Münster - Neubeckum (nur Güterverkehr)
Neubeckum - Ennigerloh - Zementwerk Anneliese (nur Güterverkehr)
Neubeckum - Lippstadt (nur Güterverkehr)
Lippstadt - Belecke - Warstein (nur Güterverkehr)
Belecke - Heidberg (nur Güterverkehr)